研究者学術情報データベース

（最終更新日 : 2021-03-31 20:04:16）　

キクチ　タケシ
菊地　武司
KIKUCHI Takeshi

所属生命科学部生命情報学科

職名教授

その他所属
1.	生命科学研究科
2.	総合科学技術研究機構創薬科学研究センター

学歴
1.		大阪市立大学博士（理学）

所属学会
1.		日本化学会
2.		日本生化学会
3.		日本生物物理学会
4.		日本蛋白質科学会

研究概要
タンパクの構造理論生命にとって基本的な役割を担うタンパクの立体構造や構造形成過程の情報をコンピュータを用いて予測し医薬分子設計に応用することを目標とする。

現在の専門分野
生物物理学, 情報生物学、計算化学 (キーワード：計算化学, 生物物理学, 情報生物学)

著書
1.	2012	Analysis of sequences of (β/α) barrel proteins based on the inter-residue average distance statistics to elucidate folding processes │ ,83-98
2.	2011	Decoding Amino Acid Sequences of Proteins using Inter-Residue Average Distance Statistics to Extract Information on Protein Folding Mechanisms │ ,465-487

論文
1.	2011	Analyses of Protein Sequences Using Inter-Residue Average Distance Statistics to Study Folding Processes and the Significance of Their Partial Sequences │ Peptide & Protein Letters │ 18,979-990
2.	2011	Analysis of the Local Sequences of Folding Sites in β Sandwich Proteins with Inter-Residue Average Distance Statistics │ The Open Bioinformatics Journal │ 5,59-68
3.	2011	Engineering the substrate specificity of Alcaligenesd-aminoacylase useful for the production of d-amino acids by optical resolution │ Journal of Chromatography B. Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences │ 879,3247– 3252
4.	2011	In silico study on the substrate binding manner in human myo-inositol monophosphatase 2 │ Journal of molecular modeling │ 17,2559–2567
5.	2011	Prediction of protein folding properties with analyses of inter-residue average distance statistics │ Peptide & Protein Letters │ 18,979-990
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学会発表
1.	2011/03	Prediction of protein folding properties with analyses of inter-residue average distance statistics （ポスター）
2.	2010/05	Relative Binding Free energy Estimation Between a protein and a ligand Based on the Free Energy Binding Principle （ポスター）
3.	2007	Prediction of Protein Folding Properties Based on Interresidue Average Distance Statistics （口頭発表，特別・招待講演等）

科学研究費助成事業
1.	2014/04 ～ 2016/03	アミノ酸配列相同性が著しく高いにも拘らず立体構造の異なるタンパク質の構造構築原理 │ 基盤研究(C)
2.	2007 ～ 2008	残基間平均距離統計を用いたタンパク構造形成部位の予測 │ 基盤研究(C)

研究高度化推進制度
1.	2016/04 2016/09	研究支援制度分類：学外研究制度種目：- 天然変性ﾀﾝﾊﾟｸ質のｱﾐﾉ酸配列解析とその創薬への応用

授業科目
1.	化学1
2.	化学1
3.	基礎物理化学
4.	機能ゲノミクス
5.	細胞･システムシミュレーション実験
全件表示（9件）

教育活動

●教育方法の実践例

1.	2008/04	固有専門科目「機能ゲノミクス」におけるタンパク３Ｄ画像を用いた教材の作成

●その他教育活動上特記すべき事項

1.	2015/05 ～ 2015/06	高校等の模擬講義：立命館宇治高校「生命科学部研究室訪問理工学部研究室訪問」を担当した。
2.	2014/08 ～ 2014/08	高校等の模擬講義：バイオインフォマティクスと生命科学
3.	2010/06 ～ 2010/06	高大連携講義：高大連携協定校プログラムにてＷｅｂ講義「わたしたちの「いのち」をささえるバイオインフォマティクス」を担当

研究者からのメッセージ
1.	タンパクの立体構造とドラッグデザイン私はもともとヘムという生物分子の電子状態を分子軌道法を用いて予測することから研究をスタートさせた。そのうちにヘムを含むヘモグロビンタンパク全体の挙動に興味をもち、タンパクそのものの構造と機能との関連に関心が広がっていった。タンパクは、生命現象のもっとも基本的な性質である自己組織化能力をもち、その挙動を解明することは生命現象の基本的な理解に繋がると期待される。一方、タンパクは生体内で様々な機能を担うがそれはタンパクの固有の立体構造に由来することが知られている。そしてタンパク構造に適合し、強く結合する化合物を設計すれば医薬分子となる可能性がある。これがコンピュータ支援ドラッグデザインの考え方である。このことはいわゆるゲノム創薬においてもキーとなる点である。私の現在の興味は、コンピュータを利用してタンパクの構造と機能との関連を理解し、それをドラッグデザインに応用することである。

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立命館大学計算生命化学研究室